【一括受注処理】確認待ち伝票に入金登録のアイコンがでたり、入金待ちの伝票に一括確認のアイコンがでたりします。処理をしてしまっても問題ないのでしょうか。

問題ございません。
表示したステータスにかかわらず、
選択した伝票で利用可能なアイコンが表示されますので、
そのまま処理をして問題ございません。

しかしながら、管理が煩雑となりますので、
確認待ちの伝票に対しては一括確認のみするなど、
ステータスに即した処理をおすすめします。

アイコンの表示の仕方について、
詳細は下記をご確認ください。

アイコンの表示の仕方

  例えば、
 「確認内容が未チェック・先払いで入金登録されていない」伝票が選択された場合、一括確認と入金登録のアイコンのどちらも表示されます。

  また、複数伝票を選択した場合は、
  全ての伝票で利用可能なアイコンのみが表示されます。

  例えば、
 「確認未チェック・先払いで未入金」の伝票と
 「確認未チェックのみ」の伝票 が選択された場合
 どちらの伝票でも利用可能な一括確認のアイコンのみが表示されます。